معماری

علم میکروبیولوژی

ماهيت جهان ميکروبي                                    

مردم غالبا ً از ميکروبها تصور بدي دارند.دليلش آن است که معدودي از ميکروبها موجبات ناراحتي آدميان را فراهم مي آورند.اما اکثر ميکروبها نسبتا ً بي ضررند ودر نتيجه تأثيرات مفيد آنها بر زيانهايشان برتري دارد.ميکروبها شايسته دقت و شناخت بيشتري هستند.در حالي که ميکروبها مي توانند بدون انسان به طور موفقيت آميزي زندگي کنند،عکس اين حالت مصداق ندارد.

وزن تمامي ميکروبهاي موجود در بيوسفر را 25 برابر وزن تمامي جانوران موجود درآن تخمين مي زنند.در حقيقت ميکروبها 90 درصد از کل موجودات زنده را تشکيل مي دهند و عمده تغييرات شيميايي که در موجودات زنده روي مي دهد بوسيله اين جانداران صورت مي گيرد.در نتيجه،آنها در بر قراري توازن در طبيعت،نقش تعيين کننده اي دارند.

در شرايط مساعد به سرعت تکثير مي يابند.تقسيم يک باکتري به دو باکتري ظرف چند دقيقه صورت مي گيرد.حتي باکتري هاي کم رشد،ظرف چند ساعت دوبرابر مي شوند.بطور نظري يک باکتري به نام اشريشياکلي در شرايط مساعد ظرف 3 روز توده اي از باکتريها را به وجود مي آورد که حجم آنها از حجم کره زمين نيز بيشتر خوهاد بود!حتي با محدوديتهايي که در شرايط عملي رشد باکتري وجود دارد،باکتري نام برده مي تواند ظرف 24 ساعت،10 باکتري جديد را پديد آورد.توانایی میکروبهای مختلف برای تحمل یا استفاده از شرایط محیطی مختلف قابل توجه است.تنوع میکروبها به حدی است که هیچ ترکیب آلی به طور طبیعی از دسترس آنها در امان نیست.در نتیجه،میکروبها تقریبا ً در همه جا یافت می شوند.در محیط های دور افتاده ای نظیر بحر المیت،سرزمینهای بی حاصل و اقیانوسهای قطبی،در کوه ها ،چشمه های گرم گوگرددار،کف اقیانوسها و لایه های بالای جو،در شرایط اسیدی و قلیایی شدید،در محلولهای غلیظ نمکها،قندها و محلولهای مربوط به فلزات سنگین یافت می شوند.محیط های عادی تر زیست میکروبها،خاک،هوا،گیاهان ،غذا و بدن جانوران است.مثالهای فوق گسترش پراکندگیمیکروبها را نشان می دهند.میکروبها ممکن است در چنین محیطهای گوناگونی ،فعالانه رشد کنند یا اینکه بقاء و تکثیرشان وقتی صورت گیرد که شرایط محیطی مناسب احراز شود.یکی از مکانیزمهایی که سبب بقای میکروبها می شود ،هاگسازی است.میکروبهای هاگساط قادرند شرایط دشوار از قبیل محیط آب جوش را برای چند دقیقه و کمبود غذا را در خاک برای چند سال تحمل کنند.

 

میکروب شناسی

میکروب شناسی دانشی است که از موجودات بسیار کوچک تک سلولی و آنهایی که از چند سلول معدود درست شده اند،صحبت می کند.ابعاد این جانداران را با میکرون (1هزارم میلیمتر)با کسری از میکرون اندازه گیری می کنند.در نتیجه برای مشاهده میکروبها،میکروسکوپ لازم است.بر عکس،بعد از تکثیر،جمعیت آنها در روی آگار یا به شکل ابر در محیطهای غذایی محلول دیده می شود.به علاوه،وجود انها در محیط از روی اثراتی که ناشی از فعالیتهای متابولیکی آنهاست،نشان داده می شودتنوع بیولوژیکی در میکروارگانیسمها بیش از سایر موجودات می‌باشد. میکروارگانیسمها موجوداتی هستند که با چشم غیر مسلح مشاهده نمی‌شوند. شکل ، عمل و خصوصیات بیوشیمیایی یا مکانیزم ژنتیکی آنها ، بر اساس محدودیتهای مولکولی بنا شده است. میکروبیولوژی راههای مفیدی را برای شناسایی میکروارگانیسمها فراهم ساخته است. در طبقه بندی موجودات زنده ، ارگانیسمهایی را که حاوی هسته بوده و هسته توسط غشایی احاطه شده است، از پروکاریوتها که DNA آنها بطور فیزیکی از سیتوپلاسم جدا نشده است، مجزا کرده‌اند. بطور کلی میکروبیولوژی درباره ویروسها ، میکروارگانیسمهای پروکاریوتی و میکروارگانیسمهای یوکاریوتی بحث می‌کند.

تاریخچه

علم میکروبیولوژی از سال 1674 هنگامی که آنتوان لوون هوک ، با عدسی شیشه‌ای خود دنیایی از موجودات ریز را در قطره آب برکه مشاهده کرد. در اواخر قرن 17 نظریه تولید خودبخودی مورد بحث قرار گرفت. در این زمان بسیاری از دانشمندان از جمله فرانسیکوردی ، فکر می‌کردند میکروارگانیسمها از مواد غیر زنده ایجاد شده‌اند. در سال 1766 اسپالانزانی نتیجه گرفت که میکروبها از هوای غیرسترون وارد محلولهای غذایی شده و آنها را فاسد می‌کنند. دو ابرمرد دنیای علم که به کنار گذاشتن نظریه خلق‌الساعه کمک شایانی کردند شیمیدان فرانسوی به نام پاستور و پزشک انگلیسی به نام تندال بود. در 100 سال گذشته میکروب شناسان موفق به دریافت چند جایزه نوبل شده‌اند.
ویروسها

 

ویروسها به علت داشتن خصوصیات خاصی با سایر موجودات زنده تفاوت دارند. یک ذره ویروس دارای مولکول اسید نوکلئیک DNA یا RNA بوده که توسط پوشش پروتئینی یا کپسید احاطه شده است. اسید نوکلئیک ویروس برای تکثیر در درون سلول به آنزیمهای سلول میزبان وابسته است. از تجمع اسید نوکلئیک و قطعات پروتئینی که به تازگی سنتز شده‌اند، ذرات کامل ویروسی تشکیل می‌شود که به محیط خارج سلول رها می‌گردند. ویروسها بسیار متنوع بوده و از نظر ساختمان ، تشکیلات ژنوم ، بیان ژنوم ، راههای تکثیر و سرایت باهم تفاوت زیادی دارند. ویروسها قادرند باکتریها ، گیاهان و جانوران را آلوده کنند.

میکروب کار

پریونها

برخی کشفیات قابل توجه در سه دهه گذشته منجر به شناسایی خصوصیات مولکولی و ژنتیکی عاملی قابل انتقال به نام عامل بیماری اسکراپی که نوعی بیماری تخریب کننده سیستم عصبی مرکزی در گوسفندان است، شده است. ساختمان پریونها فقط از پروتئین ساخته شده و فاقد اسید نوکلئیک است. بیماریهای ناشی از پریون در انسان به علت اینکه به صورت بیماریهای ژنتیکی و عفونی بروز می‌کند کاملا اختصاصی هستند. بررسی بر روی بیولوژی پریونها ، ضرورتی در تحقیقات پزشکی محسوب می‌شود.

باکتریها

 

باکتریها متنوع‌ترین و مهمترین میکروارگانیسمها هستند. تعداد کمی از آنها در انسان و حیوانات و گیاهان بیماریزا است. بطور کلی بدون فعالیت آنها ، حیات بر روی زمین مختل می‌گردد. بطور یقین یوکاریوتها از موجودات زنده باکتری مانند بوجود آمده‌اند. نظر به اینکه باکتریها ساختمان ساده‌ای داشته و می‌توان به آسانی بسیاری از آنها را در شرایط آزمایشگاه کشت داد و تحت کنترل درآورد، میکروب شناسان مطالعه وسیعی درباره فرایندهای حیاتی آنها انجام داده‌اند. درباره نحوه رشد و مرگ باکتریها ، متابولیسم باکتریها ، ژنتیک باکتریها ، ارتباط آنها با ویروسها و … مطالعات گسترده‌ای صورت گرفته است.

قارچها

قارچها دسته جداگانه‌ای از یوکاریوتها را تشکیل می‌دهند. این دسته از میکروارگانیسمها همگی هتروتروف بوده و برای رشد و تکثیر به ترکیبات آلی جهت اخذ انرژی و کربن نیاز دارند. قارچها هوازی و یا بیهوازی اختیاری هستند. اکثر قارچها ساپروفیت بوده و در خاک و آب به سر می‌برند و در این نواحی ، بقایای گیاهی و جانوری را تجزیه می‌نمایند. قارچها مانند باکتریها در تجزیه مواد و گردش عناصر در طبیعت دخالت داشته و حائز اهمیت هستند. علم مطالعه قارچهای انگل برای انسان را قارچ شناسی پزشکی گویند. که این انگلها بیماریهای زیادی را بوجود می‌آورند.

پروتوزوئرها

پروتوزوئرها جانداران یوکاریوتیک تک سلولی هستند که به قلمرو آغازیان تعلق دارند. پروتوزوئرها از نظر ساختمان تفاوت بسیاری با یکدیگر دارند. این دسته از جانداران ساکن آب و خاک بوده و از ذرات مواد غذایی و باکتریها تغذیه می‌کنند. عده‌ای از آنها بخشی از فلور طبیعی بدن جانداران را تشکیل می‌دهند. مطالعات این جانداران در محدوده علم میکروبیولوژی قرار دارد.

 

میکروبیولوژی خاک

 

خاک یکی از مخازن عمده میکروارگانیسمها محسوب می‌شود. فراوانترین میکروارگانیسمها در خاک ، باکتریها هستند. خاک باغچه در هر گرم محتوی میلیونها باکتری است. در جاهای عمیق تعداد آنها کاهش می‌یابد. قارچها به تعداد کمتر از باکتریها در خاک یافت می‌شوند. شاید مهمترین نقش میکروارگانیسمهای خاک ، شرکت آنها در چرخه‌های بیو- ژئوشیمیایی است که به گردش برخی عناصر شیمیایی در طبیعت کمک کرده و آنها را قابل مصرف می‌سازد. میکروبیولوژیستها در این زمینه تحقیقات زیادی انجام داده‌اند.

 

میکروبیولوژی آب

 

در میکروبیولوژی آب ، میکروارگانیسمها و فعالیت آنها در آبهای طبیعی نظیر دریاچه‌ها ، برکه‌ها ، رودخانه‌ها و دریاها مورد مطالعه قرار می‌گیرد. و میکروارگانیسمهای مفید و مضر برای انسان و سایر جانداران شناسایی می‌شوند.

 

میکروبیولوژی مواد غذایی

 

میکروارگانیسمها تغییرات مطلوب و نامطلوب در مواد غذایی پدید می‌آورند. و از طرف دیگر تهیه بسیاری از فرآورده‌های غذایی بدون کمک میکروارگانیسمها ، امکان‌پذیر نیست. مانند کلم شور ، زیتون رسیده و پنیر. اسیدهای حاصل توسط میکروارگانیسمها و اضافه کردن آنها به مواد غذیی مانند خیار شور آنها را از گزند میکروارگانیسمهای نامطلوب حفظ می‌کند. این بخش از میکروبیولوژی ، امروزه کاربرد زیادی دارد.

عوامل ضد میکروبی

مواد دارویی موادی هستند که برای درمان بیماریهای عفونی یا جلوگیری از وقوع بیماری بکار می‌روند . این مواد معمولا از باکتریها و قارچها بدست می‌آیند و اخیرا برخی از آنها را در کارخانجات می‌سازند. از مواد شیمیایی هنگامی می‌توان برای درمان بیماریهای عفونی استفاده کرد که دارای اثر سمی انتخابی باشند. یعنی ضمن متوقف کردن رشد یا نابودی عامل مولد بیماری ، به سلول میزبان آسیبی نرسانند. علاوه بر سمیت انتخابی ، داروها باید بتوانند به داخل بافتها و سلولهای میزبان نفوذ کننده و تغییری در مکانیزم دفاعی طبیعی میزبان بوجود نیاورند. از عوامل ضد میکروبی می‌توان به آنتی بیوتیکها اشاره کرد.

 

ارتباط میکروبیولوژی با سایر علوم

میکروبیولوژی یک علم کاربردی است که با بسیاری از شاخه‌های علوم رابطه نزدیک دارد. از جمله می‌توان به ژنتیک ، پزشکی ، زیست شناسی سلولی ، انگل شناسی ، قارچ شناسی پزشکی و بیوشیمی اشاره کرد

میکروبیولوژی

میکروبیولوژی (Microbiology) علمی است که درباره میکرو ارگانیسمها یا جانداران ذره ‌بینی بحث و گفتگو می‌کند. جانداران ذره‌ بینی به کلیه موجوداتی اطلاق می‌شوند که به علت کوچک بودن ابعاد فقط با ذره بین یا میکروسکوپ قابل مشاهده هستند. موجوداتی که در میکروبیولوژی بیشتر بررسی می‌‌شوند شامل:باکتری، ویروس، قارچ و تک سلولی ها ها یا پئوتوزوآ ها می‌‌باشد.

 

تنوع بیولوژیکی در میکروارگانیسمها بیش از سایر موجودات می‌باشد. میکروارگانیسمها موجوداتی هستند که با چشم غیر مسلح مشاهده نمی‌شوند. شکل، عمل و خصوصیات ییوشیمیایی یا مکانیزم ژنتیکی آنها، بر اساس محدودیتهای مولکولی بنا شده است. میکروبیولوژی راههای مفیدی را برای شناسایی میکروارگانیسمها فراهم ساخته است. در طبقه بندی موجودات زنده، ارگانیسمهایی را که حاوی هسته بوده و هسته توسط غشایی احاطه شده است، از پروکاریوتها که DNA آنها بطور فیزیکی از سیتوپلاسم جدا نشده است، مجزا کرده‌اند. بطور کلی میکروبیولوژی درباره ویروسها، میکروارگانیسمهای پروکاریوتی و میکروارگانیسمهای یوکاریوتی بحث می‌کند.

 

تاریخچه

 

علم میکروبیولوژی از سال 1674 هنگامی که [خآنتوان لوون هوک]]، با عدسی شیشه‌ای خود دنیایی از موجودات ریز را در قطره آب برکه مشاهده کرد. در اواخر قرن 17 نظریه تولید خودبخودی مورد بحث قرار گرفت. در این زمان بسیاری از دانشمندان از جمله فرانسیکوردی، فکر می‌کردند میکروارگانیسمها از مواد غیر زنده ایجاد شده‌اند. در سال 1766 اسپالانزانی نتیجه گرفت که میکروبها از هوای غیرسترون وارد محلولهای غذایی شده و آنها را فاسد می‌کنند. دو ابرمرد دنیای علم که به کنار گذاشتن نظریه خلق‌الساعه کمک شایانی کردند شیمیدان فرانسوی به نام پاستور و پزشک انگلیسی به نام تندال بود. در 100 سال گذشته میکروب شناسان موفق به دریافت چند جایزه نوبل شده‌اند.

 

میکروبیولوژی خاک

 

خاک یکی از مخازن عمده میکروارگانیسمها محسوب می‌شود. فراوانترین میکروارگانیسمها در خاک، باکتریها هستند. خاک باغچه در هر گرم محتوی میلیونها باکتری است. در جاهای عمیق تعداد آنها کاهش می‌یابد. قارچها به تعداد کمتر از باکتریها در خاک یافت می‌شوند. شاید مهمترین نقش میکروارگانیسمهای خاک، شرکت آنها در چرخه‌های بیو- ژئوشیمیایی است که به گردش برخی عناصر شیمیایی در طبیعت کمک کرده و آنها را قابل مصرف می‌سازد. میکروبیولوژیستها در این زمینه تحقیقات زیادی انجام داده‌اند.

 

میکروبیولوژی آب

 

در میکروبیولوژی آب، میکروارگانیسمها و فعالیت آنها در آبهای طبیعی نظیر دریاچه‌ها، برکه‌ها، رودخانه‌ها و دریاها مورد مطالعه قرار می‌گیرد. و میکروارگانیسمهای مفید و مضر برای انسان و سایر جانداران شناسایی می‌شوند.

 

میکروبیولوژی مواد غذایی

 

میکروارگانیسمها تغییرات مطلوب و نامطلوب در مواد غذایی پدید می‌آورند. و از طرف دیگر تهیه بسیاری از فرآورده‌های غذایی بدون کمک میکروارگانیسمها، امکان‌پذیر نیست. مانند کلم شور، زیتون رسیده و پنیر. اسیدهای حاصل توسط میکروارگانیسمها و اضافه کردن آنها به مواد غذیی مانند خیار شور آنها را از گزند میکروارگانیسمهای نامطلوب حفظ می‌‌کند. این بخش از میکروبیولوژی، امروزه کاربرد زیادی دارد.

 

عوامل ضد میکروبی

مواد دارویی موادی هستند که برای درمان بیماریهای عفونی یا جلوگیری از وقوع بیماری بکار می‌روند. این مواد معمولا از باکتریها و قارچها بدست می‌آیند و اخیرا برخی از آنها را در کارخانجات می‌سازند. از مواد شیمیایی هنگامی می‌توان برای درمان بیماریهای عفونی استفاده کرد که دارای اثر سمی انتخابی باشند. یعنی ضمن متوقف کردن رشد یا نابودی عامل مولد بیماری، به سلول میزبان آسیبی نرسانند. علاوه بر سمیت انتخابی، داروها باید بتوانند به داخل بافتها و سلولهای میزبان نفوذ کننده و تغییری در مکانیزم دفاعی طبیعی میزبان بوجود نیاورند. از عوامل ضد میکروبی می‌توان به آنتی بیوتیکها اشاره کرد.

 

ارتباط میکروبیولوژی با سایر علوم میکروبیولوژی یک علم کاربردی است که با بسیاری از شاخه‌های علوم رابطه نزدیک دارد. از جمله می‌توان به ژنتیک، پزشکی، زیست‌شناسی سلولی، انگل شناسی، قارچ‌شناسی پزشکی و بیوشیمی اشاره کرد.

                                                      

آغازیان

آغازیان گروه بزرگ و متنوعی از موجودات تک یاخته ای اولیه هستند که دیگر سلسله های یوکاریوتی از آنها مشتق شده اند.

مفاهیم کلیدی:

  1. سلسله آغازیان: در میان موجودات یوکاریوتی،این گروه از نظر فیلوژنتیکی سلسله ی بسیار شگفت انگیزی است.این سلسله،مرکب از یوکاریوتهایی است که جانور،گیاه یا قارچ نیستند.اکثر آغازیان تک یاخته ای هستند ولی در تعداد زیادی از شاخه ها ،پریاخته ها نیز به چشم می خورند.

 

2.کلروپلاست:کلروپلاست احتمالاً از سیانوباکترها منشأ گرفته و با گروه های مختلف آغازیان مستقلاً همزیست شده است.

3.تکامل پریاخته ای:تنوع عظیم آغازیان را می توان با پریاخته ای شدن گروهای مختلف آغازیان توضیح داد که به دفعات روی داده است.با بررسی پیشینه سه سلسله بزرگ پریاخته ای(گیاهان،جانوران،قارچها)می توان اجداد آغازی آنها را شناخت.

احتمالا مهم ترین عبارتی که درباره سلسله آغازیان می توان گفت این است که آغازیان گروهی ساختگی هستند.برای سهولت کار،همه موجودات یوکارتی تک یاخته ای بر حسب نوع دراین سلسله گروه بندی شده اند.این گروه بندی،اعضای بسیار متفاوت از یکدیگر را که فقط ارتباط اندکی با هم دارند گرد هم آورده است.قرار دادن آغازیان در”سلسله ای واحد”نشان دهنده روابط تکاملی آنها نیست.ولی در مقابل،طبقه بندی جانوران،گیاهان،قارچها،یوباکتریها،وآرکاباکتریها با توجه به روابط تکاملی آنها صورت گرفته است.به جز در موارد نادر،شاخه های مختلف آغازیان روابط بسیار دوری با یکدیگر دارند.

به تعبیری می توان گفت که قراردادن همه آغازیان در یک سلسله،نشان دهنده کمبود آگاهی ما درباره چگونگی ارتباط آنها با یکدیگر است- با پیشرفت دانش در این زمینه،این خلأ اطلاعاتی به سرعت رو به کاهش است. در میان همه گروه های جانداری که توسط زیست شناسان مطالعه شده اند ،در حال حاضر دانش ما درباره آغازیان احتمالاً پویاترین جریان مطالعاتی به شمار می رود.راجع به چگونگی طبقه بندی آغازیان،حتی در میان افراد خبره،اتفاق نظر اندکی وجود دارد.هنوز توافق حاصل نشده است که آغازیان سلسلسه ای واحد هستند یا متنوع یا اینکه بهتر است آنها را در چند سلسلسه متفاوت در ردیف حیوانات،گیاهان و قارچها قرار داد.

 

سلسله آغازیان از سال 1696،طبقه بندی پنج سلسله ای ویتاکر مورد قبول همگان است.در سالهای اخیر با جدا شدن آرکاباکتریها از سلسه ی مونرا،ششمین سلسلسه به این طبقه بندی اضافه شد.هنوز عقیده اکثریت آن است که آغازیان در گروهی متنوع و غیر یکپارچه قرار دارند.ولی باید توجه داشت که شناخت بهتر زیست شناسان از ارتباطات تکاملی اعضای سلسله ی آغازیان هر روز سریع تر از دیروز است.ارتباطات پیش از این نیز به این موضوع کمک می کنند.به نظر می رسد در چند سال آینده،نظم روشن کننده تری جایگزین سلسله ی قدیمی آغازیان بشود.

 

آغازیان یوکاریوتی هستند

یک مور تشابه آغازیان این است که آنها همگی یوکایوتی هستند.دو ویژگی مهم یوکاریوتها،رفتار جنسی و پریاخته ای بودن آنهاست.پریاخته ای بودن ،بارها به طور مستقل در گروه های مختلف اتفاق افتاده است.آغازیان فاقد ویژگی های به خصوص گیاهان،جانوارن، و قارچها هستند زیرا ویژگی های خاص آنها را ندارند.مثلاً تشکیل جنین نمی دهند و اندام های جنسی پیچیده و پریاخته ای گیاهان را ندارند.برخی از آغازیان مانند گیاهان کلروپلاست دارند و غذای خود را تولید می کنند،برخی دیگر مانند حیوانات غذای خود را هضم می کنند و گروهی نیز مانند قارچها غذای خود را جذب می کنند.

در یک طبقه بندی قدیم تر،آغازیان سبز و فتوسنتز کننده و همه ی آغازیانی که غذای خود را جذب می کنند،جزء گیاهان محسوب می شدند.از نظر تاریخی،قارچها نیز جزء گیاهان،به حساب می آمدند.آغازیانی که مانند جانوران غذای خود را هضم می کردند،جانوارن کوچک و ساده ای محسوب می شدند.این گونه طبقه بندی ها روابط پیچیده ی موجود بین گروه های مختلف آغازیان را مشخص نمی کردند و بنابراین جای خود را به طرحی از طبقه بندی دادند.قرار دادن گروهی از آغازیان جزء گیاهان،تنها به این دلیل که در دوره ی تکاملی خود مستقلاً کلروپلاست به دست آوردند و با محسوب کردن آنها جزء جانوران به این دلیل که کلروپلاست کسب نکرده اند اما حرکت می کنند،طبقه بندی بسیار گمراه کننده ای است.

شاخه هایی از آغازیان که دارای کلروپلاست هستند و فتوسنتز می کنند،در گذشته بخش(دیویژن)نامیده می شدند ولی امروزه همانند گروه های جانوران،گیاهان و قارچها،شاخه(فیلوم)نامیده می شوند.آغازیانی که کلروپلاست دارند، به طور غیر رسمی جلبک خوانده می شوند.دانشمندانی که جلبکها را بررسی می کنند فیکولوژیست نامیده می شوند.دانشمندانی که درباره آغازیان غیر خودخوراک ساز مطالعه می کنند،پروتوزئولوژیست خوانده می شوند.زیرا این موجودات را عموما ً پروتوزوآ می گویند.این اصطلاح نیز مثل آلگها (جلبکها)در بسیاری از مواقع،مفهوم غیر فنی دارد.

دو شاخه از جلبکها اساساً پریاخته ای هستند:جلبکهای قهوه ای،از شاخه ی فائوفیتا و جلبکهای قرمز از شاخه ی رودوفیتا.شاخه ی سوم ویروس ها و موجودات ساده.

 

چالش در طبقه بندی آغازیان

سه پیشنهاد مختلف امروزی برای طبقه بندی آغازیان وجود دارد.تفاوتهای عمیق موجود در این طبقه بندی ها خود گواهی است بر اختلاف عقاید در این زمینه.طبقه بندی بالایی بر اساس تفاوتهای مولکولی موجود در زیر واحدهای ریبوزومی انجام شده است.طبقه بندی میانی با تحلیل هم نیایی(کلادیستیک)ویژگی های بسیار گسترده (از جمله زیر واحدهای ریبوزومی)ارائه شده است.طبقه بندی پایینی ،خطوط اصلی ارزیابی مجدد تکاملی آغازیان را نشان می دهد و هدف ازآن به دست دادن نوعی طبقه بندی موقتی «دم دست» است تا اینکه در آینده ارتباطات تکاملی بهتری ارائه شود.در جایی که دانشمندان می پذیرند که طبقه بندی آغازیان با مشکلاتی روبرو هستند،مقایسه ی این سه طرح نشان می دهد که برخی گروهها با یکدیگر مرتبط شناخته شده اند(مانند مژکداران و دینوفلاژلیتها)و در همان حال طبقه بندی گروهی دیگر همچنان در پرده ای از ابهام قرار دارد(مانند ژیاردیا)

 

سلسله ی آغازیان سلسله ای مبهم است که گروه های مختلف بسیاری از موجودات تک یاخته ای را شامل می شود.موجودات تک یاخته ای پیچیده مانند ورتیسلا(شاخه سیلیوفورا)،که غیر خودخوراک ساز است و از باکتریها تغذیه می کند و دارای ساقه قابل انقباضی است،در هیچ یک ازگروه های جانوران یا گیاهان قرار نمی گیرند و به عنوان آغازیان طبقه بندی می شوند.

جلبکها، یعنی جلبکهای سبز از شاخه کلروفیتا،شامل موجودات پریاخته ای هستند.در هر یک از این شاخه ها،پریاخته ای شدن جداگانه به وجود امده است که ارتباطهای مستقیمی با آغازیان تک یاخته ای گوناگون دارند.جلبکهای سبز جد گیاهان محسوب می شوند ولی گیاهان و جلبکهای سبز تفاوتهای بسیار اساسی با یکدیگر دارند.علاوه بر این سه گروه مهم،تعدادی دیگر از شاخه های آغازیان نیز در دوره ی تکاملی خود پریاخته ای شده اند.

نقش همزیستی

حداقل دو اندامک مشخص یوکاریوتها،از جمله آغازیان،احتمالاًاز پروکاریوتها مشتق شده است.یکی اینکه میتورکندریها و کلروپلاستها در بسیاری از ویژگی ها با باکتریها سهیم هستند.مانند نوع خاص غشای داخلی؛و دیگری ریبوزوم متفاوت،دی ان ای، و شیوه تولید مثل.

میتوکندریها در اوایل پیدایش یوکاریوتها به وجود آمده اند و احتمالاً از باکتری های ارغوانی غیرگوگردی همزیست مشتق شده اند.فقط چند یوکاریوت هستند که میتوکندری ندارند مانند پلومیکسا پالوستریس که موجودی است شبه آمیب و غیرعادی که در بسترگِلی برکه های آب شیرین یافت می شود.پلومیکسا،ژیاردیا و تعداد کمی از آغازیان دیگر ممکن است ثمره ی مراحلی از تکامل اجداد یوکاریوتی باشند قبل از آنکه این اندامک ها را کسب کنند.

برخلاف میتوکنریها،کلروپلاستها به سه دسته تقسیم می شوند.سه دسته کلروپلاست در شیمی زیستی خود متفاوتند:

1.کلروپلاستهای جلبکهای قرمز،که دارای کلروفیل آ،کاروتنوئید و فیکوبیلین هستند.این کلروپلاستها به احتمال قوی از سیانوباکرتیهای همزیست مشتق شده اند.

2.کلروپلاستهای سبز گیاهان،جلبکهای سبز،و شاخه ای دیگر به نام اوگلنوئید که بسیار شاخص است.این کلروپلاستها حاوی کلروفیل آ و ب و کاروتنوئید هستند.علیرغم تفاوتهای زیست شیمیایی موجود بین کلروپلاستهای سه دسته از باکتریها ،به نظر می رسد تقریباً منشأ تمامی کلروپلاستها از سیانوباکتری هاست.اسا این موضوع عمدتاً برمقایسه ی جزءبه جزء نوکلئیک اسید آنها استوار است.البته هنوز احتمال ضعیفی می رود که پاره ای از کلروپلاستها از دیگر گروه های باکتری منشأ گرفته باشند.

 

آغازیان

آغازیان را در هفت گروه قرار می دهیم.بسیار مشکل است که انواع متنوع آنها را در یک طرح ساده بگنجانیم.کتابها بطور سنتی آنها را به شکلی غیر طبیعی(مانند آنچه در قرن نوزدهم اجرا شد)به فتوسنتزکننده ها(جلبکها)،غیرخودخوراک سازها(پروتوزوآها)و جذب کننده ها(آغازیان شبه قارچ)تقسیم بندی می کنند.

آغازیان را می توان با توجه به اختصاصات مشترک اصلی گروه بندی نمود.این خصوصیات انهایی هستند که متخصصان رده بندی نیز امروزه با استفاده از آنها و با بهره گیری از ویژگی هایی در پی طبقه بندی آغازیان هستند ویژگی هایی همچون داشتن یا نداشتن مژک یا تاژک؛وجود رنگدانه و نوع آنها؛نوع میتوز؛انواع تاج های موجود در میتوکندریها،ژنتیک مولکولی زیر واحد «اس»ریبوزومی،داشتن یا نداشتن اجسام درون بسته و نوع آنها،شکل کلی بدن(شبه آمیبی،شبه کوکوسی وغیره)؛وجود پوشش،پوسته،یا دیگر«حفاظها»ی بدن؛ونوع تغذیه و حرکت.موارد مذکور تنها تعدادی از ویژگی های به کار رفته در تشخیص روابط فیلوژنتیکی هستند.

به هفت معیاری که برای تعیین گروهها برگزیدیم باز هم می توان معیارهایی اضافه کرد ضمن آنکه بین زیست شناسان در اولویت دادن به معیارها توافق کلی وجود ندارد.